バングラデシュにおける最先端ゲノム研究の最前線

バングラデシュにおける最先端ゲノム研究の最前線
[The Daily Star]バイオテクノロジーにおける現代の進歩のほとんどは、クリスプルーカスシステムの発見と同じくらい公衆の想像力を獲得している。 インテリア・セラピューティックスやエディタス メディシネのようなスタートアップは、CRISPRに基づく遺伝子編集の約束を約束して数億ドルを調達しています。これは、人間の技術の歴史において真に革命的な瞬間になる可能性があります。

しかし、クリスプルーカスシステムは正確に何ですか? クリスプルーカスは、ウィルス感染からそれらを保護する細菌でしばしば見出されるDNA配列およびタンパク質の集合体である。非常に特異的なウイルスDNAのスニペットを認識し、これらのDNA配列を破壊して侵入するウイルスを排除する、ある種の「免疫系」の働きをすることができます。人間が感染性の細菌やウイルスに対する絶え間ない免疫戦争に従事しているように、バクテリア自体は攻撃して殺すウイルスと戦っています。これらの細菌を殺すウイルスはバクテリオファージ - 「細菌の食物」と呼ばれています。

クリスプルーカスが非常に特異的なDNA配列を標的とし、それを破壊して遺伝子工学の強力なツールにするのは能力です。システムがあまり正確でない場合、細菌はその標的を見逃すか、またはそれ自身のDNAを破壊し、それ自体を殺す危険があります。 2017年にCRISPR遺伝子の編集がマウスの遺伝的難聴を治癒するために使用され、同様のアプリケーションがヒトの患者にまで拡大されるのは時間の問題でしかありません。

バイオテクノロジーの多くのツールと同様に、鎮痛剤からワクチンまで、クリスプルーカスシステムは、人間の技術者や化学者によって最初から合成されていませんでした。それは野生ですでに見つかっているもので、私たち自身の目的のために形を変えることができる自然の産物です。したがって、CRISPR遺伝子編集のような技術の可能性を十分に実現するためには、このシステムの自然の多様性と機能性についてより多くの知識を生み出さなければなりません。

バングラデシュでは、このような最先端の生物学のトピックが研究と発見の活発な分野であると聞いて、多くの人々が驚いていますが、これはシャーファルク教授らのイクッドル、bで行われた最近の研究の場合とまったく同じです。 ファルケ教授は20年以上にわたりイクッドルで活発な研究チームを維持してきましたが、現在BRAC大学に移り、数学と自然科学分野の生命科学研究を強化しています。

ナツレ プブリカチオンス グループの科学的レポート誌「科学的レポート」に最近掲載されたファルケ教授の発見は、コレラを引き起こす原因となる細菌であるコレラ菌を攻撃するウイルスであるコレラバクテリオファージ群のクリスプルーカスシステムを分析したものです。 ファルケ博士の結果は、2013年にこれらのウイルス性クリスプルーカス要素を発見したアンドリュー・カミーリの研究を基にしています。

以前に研究されたクリスプルーカスシステムの大部分は、ウイルスを防御するために細菌に存在していました。顕著な紆余曲折で、ファルケ教授が研究した特定の要素が、細菌を攻撃するウイルスの代わりに存在する。

これらのコレラ殺害ウイルスは、この致命的な下痢症との闘いにおいて我々の味方である - ファルケ教授の以前の研究は、これらの自然発生ウイルスが汚染された水中の病原菌を殺すことによってバングラデシュの季節性コレラ流行を止めるのを助けることを示している。

ファルケ教授の最近の論文は、これらのウイルスがクリスプルーカスシステムを使用してコレラ菌の防御を抑制し、それらをより効果的に感染させることを示すために最先端の全ゲノムシークエンシングを使用しています。ファルケ博士と彼のグループは、バングラデシュで数年間にわたって収集された複数のウイルスと細菌からのDNA配列を研究することによって、ウイルスクリスプルーカスシステムが絶え間なく進化していることを実証することもできました。ウィルスとバクテリアは、「進化的武器競走」に閉じ込められ、その遺伝物質は常に他の防御メカニズムに反して変異している。

これらの発見は、治療のためのコレラ病原体を死滅させるウイルスや、致命的な流行の環境制御のためのウイルスのエンジニアリングに使用することができます。途上国の危機の時に、イエメンの紛争からバングラデシュのロヒンギャミャンマー国民の混雑した収容所までのコレラ流行の深刻な危険を考えると、この作業は将来人命を救う上で大きな価値があるかもしれません。

おそらく、この研究の最も注目すべき点は、バングラデシュの科学者たちによって、外国の共同研究者がいなくても完全に行われたことだろう。これらの結果は、外国の専門家に過度に依存することなく、地元の科学者を支援し、独自の研究能力を開発することの価値に対する証です。 ファルケ教授の研究チームの他のメンバーは、イフテカール・ビン・ネイザー、M モザメル ホック、ム アウスラフッガマン ナヒド、トキーMタレク、カムルザマンロッキーです。

ファルケ教授は最近、BRAC大学で新しい研究グループを立ち上げるためにイクッドル、bに就任しました。そこでは、国内最高級の私立大学の研究能力を拡大することに集中できます。ファルケ教授は、BRAC大学における将来の計画について質問すると、この新しいイニシアチブの動機を情熱的な明快さで表現しています。「この取り組みの目的は、バングラデシュ大学のライフサイエンス研究能力を構築し、バングラデシュの次世代研究者を育成するために、より多くの研究助成金を引き付ける」と述べた。

ザインオマール アルiは、フリー・ランスの科学者であり、ハーバード大学の分子生物学の修士号を取得しました。


Bangladesh News/The Daily Star 20180112
http://www.thedailystar.net/star-weekend/cutting-edge-genomic-research-bangladesh-1518433